دانشگاه‌ها و حوزه‌های علمیه نیز باید در زمینه تولید فکر و ارتقای نظریه‌های تعلیم و تربیت بکوشند زیرا کاستی‌هایی در این زمینه وجود دارد و در سند تحول، پیش‌بینی این امر صورت گرفته است.